sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-AO-A03O	1	61735	14642994	2	1
TCGA-AO-A03O	1	14644316	14809032	2	0
TCGA-AO-A03O	1	14810012	117105285	2	1
TCGA-AO-A03O	1	117108377	119241480	1	1
TCGA-AO-A03O	1	119242218	121741181	2	1
TCGA-AO-A03O	1	143285278	231918161	4	1
TCGA-AO-A03O	1	231918332	236345136	7	1
TCGA-AO-A03O	1	236346041	240020376	4	1
TCGA-AO-A03O	1	240020486	241151307	7	1
TCGA-AO-A03O	1	241152383	248930189	4	1
TCGA-AO-A03O	2	12784	70064237	2	1
TCGA-AO-A03O	2	70071020	72634777	2	2
TCGA-AO-A03O	2	72634823	74201991	2	1
TCGA-AO-A03O	2	74202065	80347076	3	2
TCGA-AO-A03O	2	80347352	82122387	2	2
TCGA-AO-A03O	2	82124080	83777728	3	2
TCGA-AO-A03O	2	83785283	88319975	2	1
TCGA-AO-A03O	2	88320080	97702572	2	2
TCGA-AO-A03O	2	97703886	98946676	5	2
TCGA-AO-A03O	2	98947965	100103107	3	2
TCGA-AO-A03O	2	100111978	242147305	2	1
TCGA-AO-A03O	3	18667	4181585	2	1
TCGA-AO-A03O	3	4188547	4600228	11	1
TCGA-AO-A03O	3	4601871	5982210	7	1
TCGA-AO-A03O	3	5985557	6973984	8	1
TCGA-AO-A03O	3	6975215	7483333	13	1
TCGA-AO-A03O	3	7485685	9293976	2	1
TCGA-AO-A03O	3	9294819	9403684	2	0
TCGA-AO-A03O	3	9406401	12706191	2	1
TCGA-AO-A03O	3	12707631	13161378	13	1
TCGA-AO-A03O	3	13162043	13458469	10	1
TCGA-AO-A03O	3	13459754	14526159	6	1
TCGA-AO-A03O	3	14526178	14572737	5	1
TCGA-AO-A03O	3	14572873	53363454	2	1
TCGA-AO-A03O	3	53365085	83022564	1	1
TCGA-AO-A03O	3	83025534	85220081	6	1
TCGA-AO-A03O	3	85222790	85533530	10	1
TCGA-AO-A03O	3	85535063	86628060	2	1
TCGA-AO-A03O	3	86628128	87215346	3	2
TCGA-AO-A03O	3	87216189	93817212	3	1
TCGA-AO-A03O	3	93821948	95369769	2	2
TCGA-AO-A03O	3	95375577	103291740	3	2
TCGA-AO-A03O	3	103292013	119841759	2	2
TCGA-AO-A03O	3	119846936	120320528	2	1
TCGA-AO-A03O	3	120325945	161102613	2	2
TCGA-AO-A03O	3	161108616	161405958	2	1
TCGA-AO-A03O	3	161408392	198169247	2	2
TCGA-AO-A03O	4	12281	33184541	2	1
TCGA-AO-A03O	4	33187382	33572503	6	3
TCGA-AO-A03O	4	33574942	33697588	10	4
TCGA-AO-A03O	4	33716001	36629533	5	2
TCGA-AO-A03O	4	36629688	36842087	9	2
TCGA-AO-A03O	4	36842638	58403011	2	2
TCGA-AO-A03O	4	58403552	58980956	9	2
TCGA-AO-A03O	4	58983300	60413791	2	2
TCGA-AO-A03O	4	60420454	60908941	3	2
TCGA-AO-A03O	4	60909927	61543437	3	1
TCGA-AO-A03O	4	61547349	62581280	4	3
TCGA-AO-A03O	4	62581332	65701480	3	2
TCGA-AO-A03O	4	65703050	66470991	3	3
TCGA-AO-A03O	4	66471379	67716502	3	1
TCGA-AO-A03O	4	67717053	69265628	3	0
TCGA-AO-A03O	4	69266404	72550188	3	1
TCGA-AO-A03O	4	72550201	73430763	5	4
TCGA-AO-A03O	4	73434824	74792391	8	3
TCGA-AO-A03O	4	74792450	76632701	6	3
TCGA-AO-A03O	4	76636503	77240353	3	3
TCGA-AO-A03O	4	77240690	77937196	3	2
TCGA-AO-A03O	4	77937361	79153903	3	0
TCGA-AO-A03O	4	79159196	82118308	4	3
TCGA-AO-A03O	4	82119022	133889418	3	0
TCGA-AO-A03O	4	133890383	136398668	3	1
TCGA-AO-A03O	4	136398819	136733811	3	0
TCGA-AO-A03O	4	136737617	136887804	3	1
TCGA-AO-A03O	4	136890018	141301887	3	0
TCGA-AO-A03O	4	141309585	141802644	3	1
TCGA-AO-A03O	4	141802740	147346952	3	0
TCGA-AO-A03O	4	147354338	147714810	3	1
TCGA-AO-A03O	4	147720314	150094571	3	0
TCGA-AO-A03O	4	150095698	150896008	2	0
TCGA-AO-A03O	4	150896200	152962306	3	0
TCGA-AO-A03O	4	152964952	153904116	5	0
TCGA-AO-A03O	4	153906822	155664314	6	0
TCGA-AO-A03O	4	155672936	179321872	3	0
TCGA-AO-A03O	4	179324182	185078389	4	0
TCGA-AO-A03O	4	185078433	187076143	6	0
TCGA-AO-A03O	4	187079499	190106768	3	0
TCGA-AO-A03O	5	15532	7441716	2	2
TCGA-AO-A03O	5	7442797	12333631	2	1
TCGA-AO-A03O	5	12337180	14518782	5	2
TCGA-AO-A03O	5	14522866	16434230	3	2
TCGA-AO-A03O	5	16434449	16805178	4	4
TCGA-AO-A03O	5	16805594	18664987	10	3
TCGA-AO-A03O	5	18666713	19292550	7	3
TCGA-AO-A03O	5	19294899	23704778	3	1
TCGA-AO-A03O	5	23705839	27966927	2	1
TCGA-AO-A03O	5	27967279	28059810	3	1
TCGA-AO-A03O	5	28066979	29616677	5	2
TCGA-AO-A03O	5	29617924	32152987	2	2
TCGA-AO-A03O	5	32155447	37582984	2	1
TCGA-AO-A03O	5	37583106	44890091	3	1
TCGA-AO-A03O	5	44891368	51498632	2	1
TCGA-AO-A03O	5	51499198	53495882	2	2
TCGA-AO-A03O	5	53501889	130187257	2	1
TCGA-AO-A03O	5	130188552	181363319	3	1
TCGA-AO-A03O	6	149661	55578315	2	1
TCGA-AO-A03O	6	55579302	65699523	3	1
TCGA-AO-A03O	6	65703930	67268144	4	2
TCGA-AO-A03O	6	67268725	69838732	4	1
TCGA-AO-A03O	6	69838818	90822234	3	1
TCGA-AO-A03O	6	90827719	91883520	4	3
TCGA-AO-A03O	6	91884333	100856802	3	1
TCGA-AO-A03O	6	100857090	101100591	4	3
TCGA-AO-A03O	6	101111662	101658362	7	3
TCGA-AO-A03O	6	101664650	102919256	4	3
TCGA-AO-A03O	6	102923347	104277015	3	1
TCGA-AO-A03O	6	104277773	105001843	3	3
TCGA-AO-A03O	6	105006903	106180035	11	3
TCGA-AO-A03O	6	106183585	107470457	19	2
TCGA-AO-A03O	6	107474863	107827443	3	1
TCGA-AO-A03O	6	107828293	108470104	3	3
TCGA-AO-A03O	6	108471341	117197230	3	1
TCGA-AO-A03O	6	117200208	117950622	3	3
TCGA-AO-A03O	6	117953613	119103072	5	4
TCGA-AO-A03O	6	119104738	119712070	15	3
TCGA-AO-A03O	6	119712516	170741917	3	1
TCGA-AO-A03O	7	43259	57088013	2	1
TCGA-AO-A03O	7	57088031	57960277	2	0
TCGA-AO-A03O	7	61081249	66462626	5	2
TCGA-AO-A03O	7	66465381	77720614	2	0
TCGA-AO-A03O	7	77722388	77831901	9	2
TCGA-AO-A03O	7	77834078	126331401	2	0
TCGA-AO-A03O	7	126335624	159334314	2	1
TCGA-AO-A03O	8	81254	1638401	2	0
TCGA-AO-A03O	8	1638469	29044219	1	0
TCGA-AO-A03O	8	29046535	31617757	2	0
TCGA-AO-A03O	8	31619880	32489714	1	0
TCGA-AO-A03O	8	32489731	33015630	3	0
TCGA-AO-A03O	8	33017609	36405161	3	3
TCGA-AO-A03O	8	36405607	36784988	2	0
TCGA-AO-A03O	8	36792784	37817347	3	2
TCGA-AO-A03O	8	37818149	40772536	2	0
TCGA-AO-A03O	8	40775019	46000405	5	0
TCGA-AO-A03O	8	46000692	46673082	1	0
TCGA-AO-A03O	8	46676693	49872827	2	1
TCGA-AO-A03O	8	49872966	50998664	2	2
TCGA-AO-A03O	8	50999365	52057390	3	2
TCGA-AO-A03O	8	52057873	56830828	3	3
TCGA-AO-A03O	8	56831522	58188701	3	2
TCGA-AO-A03O	8	58190437	58733372	6	3
TCGA-AO-A03O	8	58733373	59379202	4	4
TCGA-AO-A03O	8	59380017	62325216	7	3
TCGA-AO-A03O	8	62326319	66046052	4	4
TCGA-AO-A03O	8	66050720	66408896	9	3
TCGA-AO-A03O	8	66409076	68952943	4	3
TCGA-AO-A03O	8	68955638	71709973	6	3
TCGA-AO-A03O	8	71717823	77261272	4	4
TCGA-AO-A03O	8	77261810	78285885	7	3
TCGA-AO-A03O	8	78286407	85339212	4	4
TCGA-AO-A03O	8	85341691	87259026	11	3
TCGA-AO-A03O	8	87263721	89893370	4	4
TCGA-AO-A03O	8	89905682	95643777	7	3
TCGA-AO-A03O	8	95643808	100155467	9	3
TCGA-AO-A03O	8	100161861	101953721	10	3
TCGA-AO-A03O	8	101953920	109382577	9	3
TCGA-AO-A03O	8	109382798	114742362	11	3
TCGA-AO-A03O	8	114744115	116448233	13	3
TCGA-AO-A03O	8	116448356	117758871	16	3
TCGA-AO-A03O	8	117764102	118072968	8	3
TCGA-AO-A03O	8	118078929	118564739	20	2
TCGA-AO-A03O	8	118565090	128586455	9	3
TCGA-AO-A03O	8	128586536	135409437	7	3
TCGA-AO-A03O	8	135415756	145072769	8	3
TCGA-AO-A03O	9	46587	3371746	2	0
TCGA-AO-A03O	9	3371790	5134065	2	1
TCGA-AO-A03O	9	5134627	15241498	2	0
TCGA-AO-A03O	9	15242898	15439153	1	0
TCGA-AO-A03O	9	15445221	19054864	2	0
TCGA-AO-A03O	9	19055967	22672075	2	1
TCGA-AO-A03O	9	22673695	27382087	3	2
TCGA-AO-A03O	9	27382246	42995504	2	2
TCGA-AO-A03O	9	60840363	120238980	2	0
TCGA-AO-A03O	9	120239349	120275798	2	1
TCGA-AO-A03O	9	120282917	120853245	4	2
TCGA-AO-A03O	9	120864255	120878890	1	0
TCGA-AO-A03O	9	120881041	122059770	2	0
TCGA-AO-A03O	9	122063308	128775576	3	2
TCGA-AO-A03O	9	128777945	138200944	2	0
TCGA-AO-A03O	10	26823	22376538	3	1
TCGA-AO-A03O	10	22377728	69168218	3	2
TCGA-AO-A03O	10	69171718	81205708	2	2
TCGA-AO-A03O	10	81205989	81926693	4	2
TCGA-AO-A03O	10	81926802	89754823	2	2
TCGA-AO-A03O	10	89754990	90866391	3	2
TCGA-AO-A03O	10	90870166	91092996	6	2
TCGA-AO-A03O	10	91099615	91408779	10	2
TCGA-AO-A03O	10	91414741	96860106	2	2
TCGA-AO-A03O	10	96860848	97315869	4	2
TCGA-AO-A03O	10	97318820	99306683	2	2
TCGA-AO-A03O	10	99310439	100006349	3	2
TCGA-AO-A03O	10	100007241	100395916	4	2
TCGA-AO-A03O	10	100399318	102236819	2	2
TCGA-AO-A03O	10	102238914	104468075	4	2
TCGA-AO-A03O	10	104473681	104824995	3	2
TCGA-AO-A03O	10	104826070	105501848	6	2
TCGA-AO-A03O	10	105503812	105874168	5	2
TCGA-AO-A03O	10	105880773	106677465	3	2
TCGA-AO-A03O	10	106677881	120686941	2	2
TCGA-AO-A03O	10	120689729	121321935	10	2
TCGA-AO-A03O	10	121322840	122386028	2	2
TCGA-AO-A03O	10	122386196	122805277	7	2
TCGA-AO-A03O	10	122806227	128535685	2	2
TCGA-AO-A03O	10	128536129	129785274	3	2
TCGA-AO-A03O	10	129785289	130450432	4	2
TCGA-AO-A03O	10	130452402	132947668	3	2
TCGA-AO-A03O	10	132948457	133769379	2	2
TCGA-AO-A03O	11	198572	54790488	2	1
TCGA-AO-A03O	11	54790490	62694977	1	1
TCGA-AO-A03O	11	62696889	68539210	2	1
TCGA-AO-A03O	11	68540882	69180237	8	1
TCGA-AO-A03O	11	69188379	70120376	13	1
TCGA-AO-A03O	11	70124531	71642219	16	0
TCGA-AO-A03O	11	71642295	82089800	1	1
TCGA-AO-A03O	11	82093347	84220013	1	0
TCGA-AO-A03O	11	84220838	86771998	2	1
TCGA-AO-A03O	11	86779538	88315707	3	1
TCGA-AO-A03O	11	88319421	90213741	4	1
TCGA-AO-A03O	11	90214954	91485844	1	1
TCGA-AO-A03O	11	91495318	115714064	1	0
TCGA-AO-A03O	11	115714703	117160848	3	0
TCGA-AO-A03O	11	117164013	120013044	2	0
TCGA-AO-A03O	11	120015369	127242622	1	0
TCGA-AO-A03O	11	127248386	128078343	2	0
TCGA-AO-A03O	11	128078845	135074876	1	0
TCGA-AO-A03O	12	51460	4742214	3	2
TCGA-AO-A03O	12	4743346	37486676	2	0
TCGA-AO-A03O	12	37494436	44959405	2	1
TCGA-AO-A03O	12	44962886	45130728	3	2
TCGA-AO-A03O	12	45131003	46896366	6	2
TCGA-AO-A03O	12	46896869	47609834	4	2
TCGA-AO-A03O	12	47610954	48277081	2	1
TCGA-AO-A03O	12	48278523	48678288	4	2
TCGA-AO-A03O	12	48678307	54601984	2	1
TCGA-AO-A03O	12	54602032	56866243	3	2
TCGA-AO-A03O	12	56866408	57575135	5	2
TCGA-AO-A03O	12	57575888	57616380	6	2
TCGA-AO-A03O	12	57625196	58572887	10	2
TCGA-AO-A03O	12	58575453	59774103	5	2
TCGA-AO-A03O	12	59776118	60482309	10	1
TCGA-AO-A03O	12	60482438	61542963	6	2
TCGA-AO-A03O	12	61543057	62540662	3	2
TCGA-AO-A03O	12	62542450	62553770	7	0
TCGA-AO-A03O	12	62556776	64270837	9	2
TCGA-AO-A03O	12	64271077	64594374	4	2
TCGA-AO-A03O	12	64596595	66735358	2	2
TCGA-AO-A03O	12	66736854	67029287	5	2
TCGA-AO-A03O	12	67030294	67852835	7	2
TCGA-AO-A03O	12	67853096	68268681	2	2
TCGA-AO-A03O	12	68268831	68871818	2	1
TCGA-AO-A03O	12	68874798	69630498	30	1
TCGA-AO-A03O	12	69630746	70449646	5	2
TCGA-AO-A03O	12	70454794	71664636	3	2
TCGA-AO-A03O	12	71666614	72276891	5	2
TCGA-AO-A03O	12	72276945	72800344	4	2
TCGA-AO-A03O	12	72800386	74213383	7	2
TCGA-AO-A03O	12	74228404	76772357	2	1
TCGA-AO-A03O	12	76775611	77423192	7	2
TCGA-AO-A03O	12	77423577	77685110	4	2
TCGA-AO-A03O	12	77687167	98396556	2	1
TCGA-AO-A03O	12	98397101	98644246	1	1
TCGA-AO-A03O	12	98649661	133201603	2	1
TCGA-AO-A03O	13	18452809	26232504	1	0
TCGA-AO-A03O	13	26236541	27342103	3	0
TCGA-AO-A03O	13	27343469	28368085	1	0
TCGA-AO-A03O	13	28370599	30564709	3	0
TCGA-AO-A03O	13	30565753	35945309	1	0
TCGA-AO-A03O	13	35946598	46834899	3	0
TCGA-AO-A03O	13	46835968	88545005	2	0
TCGA-AO-A03O	13	88552003	88682840	1	0
TCGA-AO-A03O	13	88684755	114342922	2	0
TCGA-AO-A03O	14	18225647	23063776	2	2
TCGA-AO-A03O	14	23064957	23945088	3	2
TCGA-AO-A03O	14	23945103	25103328	2	2
TCGA-AO-A03O	14	25103783	26572003	12	2
TCGA-AO-A03O	14	26572686	32444017	31	1
TCGA-AO-A03O	14	32446019	51041407	2	2
TCGA-AO-A03O	14	51046095	51942912	2	1
TCGA-AO-A03O	14	51943307	68956148	2	2
TCGA-AO-A03O	14	68956447	73616975	4	2
TCGA-AO-A03O	14	73617133	84001206	2	2
TCGA-AO-A03O	14	84001618	86765410	2	1
TCGA-AO-A03O	14	86766159	106877229	2	2
TCGA-AO-A03O	15	19811075	101928837	2	1
TCGA-AO-A03O	16	10777	23843413	3	2
TCGA-AO-A03O	16	23848413	27777552	2	2
TCGA-AO-A03O	16	27777850	27804651	5	2
TCGA-AO-A03O	16	27807930	35126609	2	2
TCGA-AO-A03O	16	35127022	35215329	1	1
TCGA-AO-A03O	16	35224666	36048855	3	2
TCGA-AO-A03O	16	46429870	47203574	2	2
TCGA-AO-A03O	16	47204265	48362427	6	2
TCGA-AO-A03O	16	48368005	48949865	4	2
TCGA-AO-A03O	16	48950332	49716879	2	2
TCGA-AO-A03O	16	49720674	50711288	2	0
TCGA-AO-A03O	16	50711672	52831764	3	3
TCGA-AO-A03O	16	52836242	55132023	2	0
TCGA-AO-A03O	16	55135233	57928158	3	2
TCGA-AO-A03O	16	57933288	70716067	2	0
TCGA-AO-A03O	16	70716094	71168586	3	0
TCGA-AO-A03O	16	71168894	90221127	2	0
TCGA-AO-A03O	17	150733	29500350	3	0
TCGA-AO-A03O	17	29504782	30098734	4	1
TCGA-AO-A03O	17	30101221	64017757	3	0
TCGA-AO-A03O	17	64018579	64725497	3	1
TCGA-AO-A03O	17	64729719	82186596	3	0
TCGA-AO-A03O	17	82190394	83090856	3	1
TCGA-AO-A03O	18	48133	10371748	2	0
TCGA-AO-A03O	18	10373768	11598991	3	2
TCGA-AO-A03O	18	11602054	12210089	2	2
TCGA-AO-A03O	18	12210448	30496733	2	1
TCGA-AO-A03O	18	30506568	31556261	11	1
TCGA-AO-A03O	18	31556500	33026657	16	0
TCGA-AO-A03O	18	33034222	33974217	4	1
TCGA-AO-A03O	18	33977149	64740902	2	1
TCGA-AO-A03O	18	64751208	75160141	1	1
TCGA-AO-A03O	18	75162336	80257174	2	1
TCGA-AO-A03O	19	90910	13421690	3	0
TCGA-AO-A03O	19	13423862	13503193	5	2
TCGA-AO-A03O	19	13511519	27290048	3	0
TCGA-AO-A03O	19	27290383	37588396	3	3
TCGA-AO-A03O	19	37588490	40560555	4	2
TCGA-AO-A03O	19	40563025	45032932	2	1
TCGA-AO-A03O	19	45040529	58586487	3	1
TCGA-AO-A03O	20	80664	8945920	3	0
TCGA-AO-A03O	20	8946313	9336115	2	0
TCGA-AO-A03O	20	9336619	31841047	3	0
TCGA-AO-A03O	20	31842101	38057295	3	1
TCGA-AO-A03O	20	38057349	38122367	6	3
TCGA-AO-A03O	20	38125472	39682727	7	3
TCGA-AO-A03O	20	39683574	40356618	12	3
TCGA-AO-A03O	20	40357346	41666822	5	3
TCGA-AO-A03O	20	41667648	43162345	4	3
TCGA-AO-A03O	20	43162530	47562649	3	2
TCGA-AO-A03O	20	47565667	49382625	3	3
TCGA-AO-A03O	20	49391744	49928574	6	3
TCGA-AO-A03O	20	49929073	50322539	4	3
TCGA-AO-A03O	20	50323302	52300383	3	1
TCGA-AO-A03O	20	52303502	54998409	7	1
TCGA-AO-A03O	20	54998858	55260907	3	1
TCGA-AO-A03O	20	55265289	55480528	6	1
TCGA-AO-A03O	20	55485062	56358079	6	3
TCGA-AO-A03O	20	56358390	56451685	11	6
TCGA-AO-A03O	20	56454332	56970912	5	5
TCGA-AO-A03O	20	56971267	57528700	8	5
TCGA-AO-A03O	20	57529936	58776573	5	3
TCGA-AO-A03O	20	58776648	64324800	3	3
TCGA-AO-A03O	21	10336543	15684901	3	0
TCGA-AO-A03O	21	15686394	20761782	4	0
TCGA-AO-A03O	21	20767142	22520990	3	0
TCGA-AO-A03O	21	22527283	27679516	4	0
TCGA-AO-A03O	21	27685409	32775590	3	0
TCGA-AO-A03O	21	32780516	39519764	4	0
TCGA-AO-A03O	21	39519935	40906019	3	0
TCGA-AO-A03O	21	40907940	43189751	4	0
TCGA-AO-A03O	21	43189772	46291778	4	1
TCGA-AO-A03O	21	46299213	46677045	4	0
TCGA-AO-A03O	22	15294545	28545083	3	2
TCGA-AO-A03O	22	28546899	33510175	3	1
TCGA-AO-A03O	22	33510191	50796027	2	1
TCGA-AO-A03O	X	251810	4283885	2	1
TCGA-AO-A03O	X	4285013	26406160	2	2
TCGA-AO-A03O	X	26411743	27161467	2	1
TCGA-AO-A03O	X	27167560	156004181	2	2
